ВВЕДЕНИЕ
Глиобластома является наиболее распространенной первичной злокачественной опухолью головного мозга и характеризуется быстрыми темпами роста первичного узла опухоли, высокой инвазивностью, склонностью к метастазированию и рецидивам заболевания [1, 2]. Несмотря на повсеместное внедрение стандарта тройной терапии злокачественных глиом у взрослых, включающей резекцию опухоли с проведением химио- и радиотерапии, 50%-выживаемость пациентов остается на крайне низком уровне и составляет около 15 месяцев. Проблема заключается в возобновлении опухолевого роста в зоне первичного очага из-за невозможности тотального удаления опухолевых клеток при хирургической операции и резистентности части клеток к радио- и химиотерапии [3].
Перспективным подходом к лечению злокачественных глиом является онколитическая вирусная терапия, направленная на прямой лизис опухолевых клеток, модификацию микроокружения опухоли, ингибирование туморогенной васкуляризации и активацию специфического Т-клеточного иммунитета к опухолевым антигенам [4, 5].
Онколитический вирус может вводиться непосредственно в опухоль при ангиографии до радикальной операции и/или действовать в синергизме с проводимой химио- и радиотерапией, разрушая резистентные к терапевтическому воздействию опухолевые клетки и воздействуя на микроокружение опухоли.
Проводится большое количество исследований, направленных на повышение эффективности лечения злокачественных глиом с применением различных онколитических вирусов, обладающих естественной или индуцированной онколитической активностью и избирательным тропизмом к клеткам опухоли [4-6]. Для повышения эффективности лечения разрабатываются различные стратегии, при которых вирус может выступать в качестве вектора, экспрессирующего иммуноактивные молекулы (хемокины, цитокины, наноантитела к PD1-L1 и другие), которые воздействуют на опухолевое микроокружение и/или потенцируют онколитическое действие вируса [7, 8].
Онколитические свойства модифицированного вируса гриппа были продемонстрированы в ряде доклинических исследований [9-14]. Общими выводами этих работ, включая наш собственный опыт, являются: (i) прямая зависимость эффективности онколитической терапии от вводимой дозы вируса (вирусные концентраты с наличием 1010/мл вирусных частиц обладают максимальной активностью); (ii) безопасность введения онколитического вируса в высоких титрах непосредственно в ткань опухоли; (iii) повышенная онколитическая активность вирусов гриппа с модифицированным геном ns1, за счет усиленной стимуляции системы врожденного иммунитета в зоне аппликации вируса, (iv) высокая генетическая пластичность РНК-сегментированного генома вируса гриппа, что позволяет селекционировать штамм, адаптированный к конкретному типу опухоли.
Дополнительное преимущество, с точки зрения селективности воздействия и эффективности проникновения вирусной частицы в клетку хозяина, могут иметь эластазо-зависимые вирусы гриппа, которые получают путем направленного мутагенеза или селекции [15]. Так как ряд опухолей человека, включая глиобластомы, обладают повышенной эластазной активностью за счет нейтрофильной инфильтрации, эластазо-зависимый вирус гриппа имеет потенциал многоцикловой репродукции в опухолевом очаге, но не в здоровых тканях, где ферментативная активность эластазы в норме отсутствует.
В настоящем исследовании нами получены генетически стабильные трипсин-зависимые и эластазо-зависимые репортерные гриппозные векторы, обладающие высокой инфекционной и репортерной активностью, а также способностью инфицировать глиальные клетки. В экспериментах in vivo на крысах показано, что интракраниальное введение вируса в высокой дозе является безопасным для животных и сопровождается накоплением люциферазы в месте введения без формирования инфекционного вирусного потомства.
МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ
Плазмиды
Плазмида pHW-PR8-NS124-2A-Luc была получена на основе ранее сконструированной плазмиды pHW-PR8-NS124-Luc [16, 17], в которой белок-кодирующие последовательности (NS1124 и NanoLuc) были разделены P2A-пептидом (ATNFSLLKQAGDVEENPGP) Porcine Teschovirus 1 [18], обеспечивающим «проскок» рибосомы (Евроген, Россия). Плазмида, кодирующая гемагглютинин вируса гриппа A/Puerto Rico/8/1934 (H1N1) (A/PR/8/34) с мутациями S342P, R343I [15], была получена путем сайт-направленного мутагенеза (Евроген, Россия). Плазмиды, кодирующие внутренние и поверхностные белки вируса гриппа A/PR/8/34 были получены из коллекции Лаборатории векторных вакцин ФГБУ «НИИ гриппа им. А. А. Смородинцева» Минздрава России.
Клеточные культуры
Клетки Vero (ATCC #CCL-81, США) культивировали в среде OptiPro (Gibco, США) с добавлением 2% GlutaMax (Gibco, США). Клетки MDCK (#FR-58; IRR, США), А172, T98G и Т2 (ФГБУ «Российский научный центр радиологии и хирургических технологий им. акад. А. М. Гранова», Россия) растили в среде АльфаМЕМ (Биолот, Россия) с добавлением 10% эмбриональной сыворотки (Биолот, Россия). Клетки глиомы крысы С6 (ФГБУ «НИИ гриппа им. А. А. Смородинцева») культивировали в среде DMEM (Биолот, Россия) c добавлением 20% сыворотки SC-biol, 1% GlutaMax и 1% пирувата натрия (Gibco, США).
Получение вирусов
Рекомбинантный вирус гриппа A/PR8-NS124-Luc (T_NS124-Luc) был получен ранее [16, 17]. Для сборки рекомбинантных вирусных векторов T_NS124-2A-Luc, E_NS124-Luc и E_NS124-2А-Luc клетки Vero трансфицировали набором из 8-ми двунаправленных плазмид [19] с использованием нуклеофектора Nucleofector II (Amaxa) и набора реагентов Nucleofection Kit V (Lonza #VCA-1003, Швейцария). Трипсин-зависимые штаммы T_NS124-Luc и T_NS124-2A-Luc накапливали в 10-12-дневных развивающихся куриных эмбрионах (РКЭ) (Синявинская птицефабрика, Россия), эластазо-зависимые штаммы E_NS124-Luc и E_NS124-2A-Luc – в клетках MDCK в присутствии 0.5 мкг/мл эластазы (Promega, США).
Определение инфекционной активности
Инфекционную активность вирусов определяли методом предельных разведений в культурах клеток MDCK, Vero и в системе РКЭ. Разведение вирусов для заражения клеток MDCK и Vero осуществляли в среде АльфаМЕМ или OptiPro с добавлением антибиотика-антимикотика (Gibco, США) и протеазы (1 мкг/мл ТРСК-трипсина или 0.5 мкг/мл эластазы). Для заражения РКЭ вирусы разводили в буфере DPBS (Биолот, Россия) с добавлением антибиотика-антимикотика. Для расчета 50% инфекционной дозы был использован метод Рида и Менча [20].
Постановка ОТ-ПЦР
Вирусную РНК выделяли набором реагентов RNeasy Mini Kit (Qiagen, Нидерланды). Генетический материал амплифицировали набором реагентов БиоМастер ОТ-ПЦР–Экстра (Биолабмикс, Россия) и специфичных праймеров к сегменту NS [21]. ОТ-ПЦР с детекцией в режиме реального времени проводили с использованием набора реагентов БиоМастер ОТ-ПЦР-Экстра (2х) (Биолабмикс, Россия), праймеров InfA-F, InfA-R и олигонуклеотидного зонда InfA-P.
Измерение люциферазной активности
Измерение ферментативной активности люциферазы проводили с использованием набора реагентов Nano-Glo Luciferase Assay System (Promega, США), планшетов с темными стенками (Thermo Fisher Scientific, США) и мультифотометра CLARIOstar (BMG LABTECH, Германия). Оценку хемилюминесценции in vivo проводили на приборе IVIS SpectrumCT In Vivo Imaging System (PerkinElmer, США).
Электрофоретическое разделение белков и Вестерн-блот анализ
Клетки MDCK, зараженные рекомбинантными штаммами в дозе 1 ТИД50/клетку, инкубировали в течение 18 часов, лизировали и переносили в полиакриламидный гель (Any kD Mini-PROTEAN TGX Stain-Free Protein Gel, Bio Rad, США). Разделенные белки переносили на нитроцеллюлозную мембрану (Trans-Blot Turbo Transfer Packs, Bio Rad, США) и окрашивали с использованием моноклональных антител 1Н7 против белка NS1 вируса гриппа [22] с последующим проявлением конъюгатом Goat Anti-Mouse IgG H&L (HRP) (Abcam, Великобритания) и субстратом Pierce 1-Step Ultra TMB-Blotting Solution (Thermo Fisher Scientific, США).
Количественная оценка инфицированных клеток методом проточной цитометрии
Клетки заражали рекомбинантными штаммами в дозе 7.0 log10 ТИД50/клетку и инкубировали в течение 18-20 часов в среде, содержащей 2% сыворотки. Окрашивание проводили набором Zombie Aqua Fixable Viability Kit (BioLegend, США) и FITC-мечеными антителами к нуклеопротеину вируса гриппа А (ППДП, Россия). Для анализа использовали проточный цитометр CytoFLEX (Beckman Coulter, США) и программу Kaluza Analysis v2 (Beckman Coulter, США).
Лабораторные животные
Лабораторные крысы Wistar (самки, 10-12 недель, 250-300 г) были получены из филиала «Столбовая» ФГБУ НЦБМТ ФМБА России. Исследования проводили в соответствии с международными рекомендациями (Директива 2010/63/EU).
Оценка безопасности вируса при интракраниальном введении крысам
Репортерный гриппозный вектор T_NS124-2А-Luc был сконцентрирован и очищен методом ультрафильтрации и диафильтрации в тангенциальном потоке. Препараты вводили интракраниально в мягкую мозговую оболочку крыс в объеме 10 мкл с помощью нанолитрового инъектора RWD Life Science R480 Nanoliter Injection Pump. Наблюдение за клиническим состоянием животных (по 5 крыс в группе) проводили в течение 10 дней с последующей оценкой неврологического дефицита [23]. Персистенцию вируса в месте инъекции оценивали по люминесцентной активности и наличию вирусного генетического материала и его инфекционной активности через 24, 48 и 72 часа после введения препарата двум-трем крысам в экспериментальной группе T_NS124-2А-Luc и одному животному в интактной группе.
Статистическая обработка
Графическую визуализацию и статистическую обработку данных проводили в программах MSExcel и GraphPad Prism v9.5.1. Для проверки гипотезы о нормальности распределений данных использовали критерий Шапиро-Уилка. Если гипотеза о нормальности не могла быть отвергнута, значимость различий между группами определяли в дисперсионном анализе с апостериорным тестом Тьюки. В противном случае использовали тест Краскела-Уоллиса с последующим критерием Данна. Уровень значимости принимали равным 0.05.
РЕЗУЛЬТАТЫ
Конструирование и характеристика репортерных гриппозных векторов
Репортерные штаммы вируса гриппа, обладающие хемилюминесцентной активностью, были получены методом обратной генетики [19]. Для сборки вирусов были использованы плазмиды, кодирующие модифицированный ген NS, в которых белок-кодирующие последовательности вирусного белка NS1124 и люциферазы NanoLuc [24] были либо слиты, либо разделены сайтом 2А, обеспечивающим ко-трансляционное разделение белков. Схематическое изображение химерных генов NS представлено на Рис. 1А.

Для изменения специфичности к протеолитическим ферментам в плазмиду, кодирующую гемагглютинин (НА) штамма вируса гриппа A/PR/8/34, были введены точечные мутации S342→P и R343→I, приводящие к замене сайта протеолитического расщепления с трипсинового на эластазный (Рис. 1А). Остальные гены были заимствованы от лабораторного штамма A/PR/8/34.
В результате был получен набор из четырех репортерных векторов: вирусы T_NS124-Luc и T_NS124-2A-Luc содержали НА, расщепляемый трипсин-подобными сериновыми протеазами; штаммы E_NS124-Luc и E_NS124-2A-Luc содержали модифицированный НА, активируемый эластазой.
Генетическая стабильность и репродуктивная активность сконструированных векторов
Все сконструированные векторы были генетически стабильны на протяжении пяти последовательных пассажей. На Рис. 1Б приведены результаты ОТ-ПЦР, демонстрирующие соответствие длины геномного сегмента NS пятого пассажа штаммов контрольным плазмидам. Продукты амплификации геномного сегмента NS клонов предыдущих пассажей также соответствовали контрольным плазмидам (данные не представлены). Биолюминесцентный сигнал для всех штаммов достигал 105 ОЕ. Экспрессия химерного белка NS1 была подтверждена при анализе лизата клеток методом Вестерн-блот анализа (Рис. 1В). Соответствие молекулярных масс синтезируемых химерных белков теоретически предсказанному было подтверждено методом окрашивания нитроцеллюлозной мембраны антителами к белку NS1 (Рис. 1Г). Также было продемонстрировано частичное ко-трансляционное разделение химерного белка в сайте «проскока рибосомы» 2А (Рис. 1В, дорожки 3 и 4).
Репродуктивная активность трипсин-зависимых и эластазо-зависимых репортерных штаммов достигала 8.0 log10 ТИД50/мл при культивировании в клеточных линиях Vero и MDCK. Ростовые характеристики рекомбинантных вирусов в отсутствие экзогенных протеаз в системе РКЭ ожидаемо различались. Инфекционная активность трипсин-зависимых штаммов T_NS124-Luc и T_NS124-2A-Luc в РКЭ достигала 9.0 log10 ЭИД50/мл. В то же время эластазо-зависимые вирусы E_NS124-Luc и E_NS124-2А-Luc не реплицировались в куриных эмбрионах без добавления экзогенной эластазы. Наличие сайта ко-трансляционного разделения 2А не оказывало существенного влияния на инфекционную активность штаммов, что свидетельствовало о сохранении их функциональной активности и стабильности конструкции.
Для подтверждения специфичности протео-литического расщепления НА трипсином и эластазой проводили оценку репродуктивной и репортерной активности сконструированных штаммов при культивировании вирусов в средах, содержащих как гомологичные, так и гетерологичные протеазы (Рис. 2).

Инкубация клеток, зараженных репортерными вирусными штаммами, в среде с гомогенной протеазой инициировала многоцикловую инфекцию. Пик репродуктивной активности был зафиксирован через 48 часов после заражения и составил 7.7 log10 ТИД50/мл для трипсин-зависимых штаммов и 7.0 log10 ТИД50/мл для эластазо-зависимых вирусов. Присутствие сайта 2А между последовательностями белка NS1124 и люциферазы NanoLuc не влияло на скорость репродукции вирусов, что подтверждает универсальность данной конструкции.
Люциферазная активность штаммов, растущих в среде, содержащей гетерологичную протеазу, не превышала 103 ОЕ, достигая пика к 24 часам. Среди всех штаммов наиболее высокий уровень люминесцентного сигнала в условиях добавления гетерологичной протеазы был зарегистрирован для трипсин-зависимого вируса со вставкой 2А сайта.
Инкубация зараженных клеток в среде с гомологичной протеазой обеспечивала интенсивное люминесцентное свечение, достигающее 105 ОЕ, что подтверждает специфичность сайта протеолитического расщепления НА. Пик люциферазной активности для трипсин-зависимых вирусов детектировали через 24 часа после инфекции, а для эластазо-зависимых штаммов – через 48 часов.
Таким образом были сконструированы и охарак-теризованы генетически стабильные репортерные гриппозные векторы, репродукция которых зависела от наличия трипсина (T_NS124-Luc и T_NS124-2А-Luc) или эластазы (E_NS124-Luc и E_NS124-2А-Luc). Все вирусы демонстрировали высокую люминесцентную активность, достигающую 105 ОЕ в присутствии соответствующего протеолитического фермента. Репортерная и инфекционная активность штаммов не зависела от присутствия сайта 2А перед последовательностью люциферазы NanoLuc.
Эффективность инфицирования глиомных клеточных линий сконструированными штаммами
Для оценки онколитического потенциала разработанных репортерных штаммов была изучена их способность инфицировать опухолевые клеточные культуры. В качестве модели опухоли использовали клеточную линию глиомы крысы С6, первичную культуру Т2 [27] и перевиваемые клеточные линии глиобластомы человека А172 и Т98G. Для сравнения была использована пермиссивная культура клеток MDCK.
Долю инфицированных клеток определяли методом проточной цитометрии с использованием флуоресцентно меченных моноклональных антител против нуклеопротеина (NP) вируса гриппа. Полученные данные позволили определить эффективность заражения различных клеточных линий (Рис. 3).

Наибольшая эффективность инфицирования клеток сконструированными репортерными векторами была зафиксирована в клеточной линии глиомы крысы С6 и первичной культуры глиобластомы Т2 [27]. В клеточных линиях глиобластомы человека A172 и T98G процент инфицированных клеток оказался ниже, составляя около 50% от уровня инфицирования пермиссивной линии MDCK.
Примечательно, что векторы T_NS124-2A-Luc и E_NS124-2A-Luc, содержащие 2А сайт в химерном гене ns1, демонстрировали значительно более высокий процент инфицированных клеток по сравнению с вирусами T_NS124-Luc и E_NS124-Luc, не содержащими 2А сайт (p<0.05, Рис. 3). Это указывает на потенциальную роль 2А сайта в улучшении способности векторов заражать клетки глиомы.
Безопасность вектора при интракраниальном введении
Ключевым этапом разработки онколитической терапии глиобластом является оценка безопасности изучаемого препарата при интракраниальном введении в мягкую мозговую оболочку здоровым животным. Для исследования безопасности был выбран предварительно очищенный и сконцентрированный до 9 log10 ЭИД50/мл штамм T_NS124-2А-Luc. План эксперимента представлен на Рис. 4A. Наблюдение за животными проводили на ежедневной основе в течение 10 дней. В этот период снижения массы тела животных и летальных исходов зафиксировано не было (Рис. 4Б).


Для изучения персистенции вируса в головном мозге крысы оценивали люминесцентную активность вектора, присутствие генетического материала вируса и его инфекционную активность в течение первых 72 часов после введения (Рис. 4В-Д).
Во всех исследованных образцах ткани головного мозга во всех временных точках наблюдали высокий уровень люминесцентного сигнала (до 105 ОЕ), достаточный для прижизненной визуализации NanoLuc в составе гриппозного вектора (Рис. 4Е).
Примечательно, что инфекционную нагрузку и вирусную РНК в образцах головного мозга уже через 72 часа после введения вектора обнаружить не удалось. Эти данные подтверждают ограниченную репликацию вируса и его быстрое выведение из тканей головного мозга, что свидетельствует о безопасности репортерного вектора.
При изучении общей двигательной активности и поисково-исследовательского поведения животных статистически значимых различий между экспериментальной и контрольной группами не выявлено (Рис. 5). Полученные данные свидетельствуют об отсутствии неврологических нарушений у лабораторных животных после интракраниального введения репортерного вектора.
Таким образом, интракраниальное введение репортерного гриппозного вектора было безопас-ным для крыс, не вызывало неврологического дефицита, и сопровождалось синтезом люциферазы NanoLuc, детектируемой прижизненно in situ в месте введения.
ОБСУЖДЕНИЕ
В настоящее время использование онколитических вирусов считается перспективным методом иммунотерапии глиобластом. Подтверждением этому является большое количество клинических исследований различных онколитических вирусных кандидатов, включая вирусы герпеса (HSV-1), реовирус (Reovirus, Reolysin), аденовирусы, вирус везикулярного стоматита (VSV), парамиксовирусы (вирус кори, вирус болезни Ньюкасла), вирус оспы коров, вирус Сендай и полиовирус [1-6, 28, 29]. Данные вирусы обладают способностью не только напрямую разрушать опухолевые клетки, но и модифицировать опухолевое микроокружение, усиливая противоопухолевый иммунный ответ [28, 30]. Вирусы гриппа, благодаря своей способности стимулировать врожденный иммунитет и цитотоксический Т-клеточный ответ, представляют собой перспективные кандидаты для онколитической терапии [31-33]. Однако их применение сопряжено с рядом ограничений и вызовов.
Одной из ключевых проблем является наличие нейтрализующих антител к современным штаммам вируса гриппа А, что связано с частыми сезонными эпидемиями и массовой вакцинацией [34]. Это может значительно снизить эффективность гриппозных векторов в качестве онколитических агентов. Альтернативой является использование «старых» вирусов гриппа, к которым в популяции отсутствует иммунитет, но такие вирусы несут риски вирулентности, генетической нестабильности и потенциального эпидемического распространения. Кроме того, некоторые штаммы вируса гриппа обладают нейротропностью, что может приводить к неврологическим осложнениям, в связи с чем требуется тщательная оценка их безопасности [35, 36].
Несмотря на эти ограничения, вирусы гриппа обладают уникальными характеристиками, позволяющими создавать гиператтенуированные векторы для целевой экспрессии трансгенов, таких как цитокины и хемокины, в зоне опухолевого роста [7, 8]. Эти трансгены могут усиливать противоопухолевый иммунный ответ, активируя Т клетки, NK клетки и макрофаги, а также способствуя инфильтрации иммунных клеток в опухоль [7].
В рамках настоящего исследования были разработаны репортерные векторы вируса гриппа, активируемые трипсиноподобными протеазами (T_NS124-Luc, T_NS124-2A-Luc) или опухоль-ассоциированной эластазой (E_NS124-Luc, E_NS124-2A-Luc). Для этого в сайт расщепления HA были внесены мутации S342→P и R343→I. Векторы показали высокую эффективность заражения клеточных линий глиом (С6, T2, А172, T98G), при этом отмечена повышенная инфекционная активность конструкций с сайтом 2A, обеспечивающим ко-трансляционное разделение белков. Это может быть связано с улучшением функциональной активности белка NS1 при его разделении с трансгеном.
Эксперименты in vivo показали, что интракраниальное введение трипсино-зависимого вектора T_NS124-2A-Luc в высокой дозе было безопасно для крыс и не приводило к развитию неврологического дефицита. При этом люминесцентный репортер NanoLuc экспрессировался в месте введения вектора, что позволило визуализировать зону введения вируса. Важно отметить, что экспрессию трансгена наблюдали в отсутствии активной вирусной репликации.
Полученные результаты открывают перспективы дальнейшей оптимизации вирусных векторов, изучения фармакокинетики трансгенов и разработки онколитических препаратов на основе вируса гриппа, экспрессирующих цитокины и хемокины. Кроме того, векторы, экспрессирующие NanoLuc, могут обладать собственным терапевтическим эффектом за счёт иммуномодулирующего действия модифицированного белка NS1. Замена NanoLuc на хемокины, такие как CXCL-9/10/11, может усилить терапевтический эффект векторов, способствуя активации противоопухолевого иммунитета и модификации микроокружения опухоли [7, 37]. Это направление станет основой для дальнейших исследований, направленных на создание безопасных и эффективных онколитических препаратов для терапии злокачественных глиом.